Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcam1Q99NB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcam1Q99NB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcam1Q99NB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcam1Q99NB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcam1Q99NB3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcam1Q99NB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcam1Q99NB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcam1Q99NB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcam1Q99NB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms