Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col25a1Q99MQ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col25a1Q99MQ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col25a1Q99MQ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col25a1Q99MQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col25a1Q99MQ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col25a1Q99MQ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms