Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmed9Q99KF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmed9Q99KF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed9Q99KF1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed9Q99KF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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