Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atad3Q925I1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atad3Q925I1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atad3Q925I1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atad3Q925I1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms