Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp8Q924X6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp8Q924X6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrp8Q924X6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrp8Q924X6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp8Q924X6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms