Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ripply3Q924S9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ripply3Q924S9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ripply3Q924S9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ripply3Q924S9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms