Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Supt16hQ920B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Supt16hQ920B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt16hQ920B9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt16hQ920B9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Supt16hQ920B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms