Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hdac11Q91WA3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Hdac11Q91WA3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hdac11Q91WA3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Hdac11Q91WA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Hdac11Q91WA3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Hdac11Q91WA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms