Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a8Q8R4D1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc9a8Q8R4D1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a8Q8R4D1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a8Q8R4D1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a8Q8R4D1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a8Q8R4D1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms