Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Agr3Q8R3W7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Agr3Q8R3W7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Agr3Q8R3W7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Agr3Q8R3W7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms