Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pof1bQ8K4L4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pof1bQ8K4L4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pof1bQ8K4L4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pof1bQ8K4L4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pof1bQ8K4L4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pof1bQ8K4L4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms