Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsl1Q8K305 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsl1Q8K305 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsl1Q8K305 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms