Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S1

Lgi4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi4Q8K1S1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lgi4Q8K1S1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lgi4Q8K1S1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lgi4Q8K1S1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgi4Q8K1S1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgi4Q8K1S1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237 ms