Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp1Q8K021 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp1Q8K021 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp1Q8K021 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp1Q8K021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms