Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d5Q8JZW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh2d5Q8JZW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d5Q8JZW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms