Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne5Q8JZW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne5Q8JZW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne5Q8JZW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne5Q8JZW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne5Q8JZW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne5Q8JZW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne5Q8JZW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms