Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TwnkQ8CIW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TwnkQ8CIW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TwnkQ8CIW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TwnkQ8CIW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms