Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII0

Zbtb8b, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8bQ8CII0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb8bQ8CII0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbtb8bQ8CII0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbtb8bQ8CII0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbtb8bQ8CII0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbtb8bQ8CII0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms