Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CopaQ8CIE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CopaQ8CIE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CopaQ8CIE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CopaQ8CIE6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CopaQ8CIE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms