Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc8Q8CFD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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