Protein–RNA interactions for Protein: Q8CET2

4921504E06Rik, RIKEN cDNA 4921504E06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921504E06RikQ8CET2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4921504E06RikQ8CET2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4921504E06RikQ8CET2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
4921504E06RikQ8CET2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4921504E06RikQ8CET2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
4921504E06RikQ8CET2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4921504E06RikQ8CET2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921504E06RikQ8CET2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921504E06RikQ8CET2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921504E06RikQ8CET2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms