Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms