Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef8Q8CE24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef8Q8CE24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef8Q8CE24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef8Q8CE24 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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