Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9030612E09RikQ8CE20 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9030612E09RikQ8CE20 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9030612E09RikQ8CE20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms