Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc73Q8CDM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc73Q8CDM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc73Q8CDM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc73Q8CDM4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc73Q8CDM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms