Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E4f1Q8CCE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E4f1Q8CCE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E4f1Q8CCE9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
E4f1Q8CCE9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
E4f1Q8CCE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
E4f1Q8CCE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms