Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samd4aQ8CBY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samd4aQ8CBY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd4aQ8CBY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms