Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn3Q8CBC6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrn3Q8CBC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn3Q8CBC6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrn3Q8CBC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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