Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc186Q8C9S4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc186Q8C9S4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc186Q8C9S4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms