Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe22Q8C6A8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms