Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Camsap2Q8C1B1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Camsap2Q8C1B1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Camsap2Q8C1B1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Camsap2Q8C1B1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Camsap2Q8C1B1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Camsap2Q8C1B1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Camsap2Q8C1B1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Camsap2Q8C1B1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Camsap2Q8C1B1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Camsap2Q8C1B1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Camsap2Q8C1B1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms