Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube3dQ8BX13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube3dQ8BX13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3dQ8BX13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube3dQ8BX13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube3dQ8BX13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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