Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp4Q8BWW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp4Q8BWW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp4Q8BWW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp4Q8BWW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp4Q8BWW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Larp4Q8BWW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Larp4Q8BWW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Larp4Q8BWW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Larp4Q8BWW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Larp4Q8BWW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms