Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730596B20RikQ8BQ08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5730596B20RikQ8BQ08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730596B20RikQ8BQ08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms