Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zcchc4Q8BKW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zcchc4Q8BKW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc4Q8BKW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc4Q8BKW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms