Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHF7

Pgs1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgs1Q8BHF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pgs1Q8BHF7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pgs1Q8BHF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgs1Q8BHF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms