Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vipas39Q8BGQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vipas39Q8BGQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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