Protein–RNA interactions for Protein: Q80W47

Wipi2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipi2Q80W47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wipi2Q80W47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wipi2Q80W47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wipi2Q80W47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Wipi2Q80W47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wipi2Q80W47 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wipi2Q80W47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wipi2Q80W47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wipi2Q80W47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wipi2Q80W47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms