Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Avl9Q80U56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Avl9Q80U56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Avl9Q80U56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Avl9Q80U56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Avl9Q80U56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Avl9Q80U56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms