Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmQ7TSN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmQ7TSN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClmQ7TSN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClmQ7TSN2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.1 ms