Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg1bQ7TSF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1bQ7TSF1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms