Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim12Q78RX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim12Q78RX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smim12Q78RX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms