Protein–RNA interactions for Protein: Q71FD5

Znrf2, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf2Q71FD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf2Q71FD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znrf2Q71FD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znrf2Q71FD5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms