Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv1Q704Y3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpv1Q704Y3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpv1Q704Y3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv1Q704Y3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms