Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Topbp1Q6ZQF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Topbp1Q6ZQF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Topbp1Q6ZQF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34,2■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34,2■■■■□ 3,07
Topbp1Q6ZQF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Topbp1Q6ZQF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Topbp1Q6ZQF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Topbp1Q6ZQF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms