Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igsf3Q6ZQA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Igsf3Q6ZQA6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Igsf3Q6ZQA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igsf3Q6ZQA6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Igsf3Q6ZQA6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms