Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chsy1Q6ZQ11 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chsy1Q6ZQ11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chsy1Q6ZQ11 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chsy1Q6ZQ11 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chsy1Q6ZQ11 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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