Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M2Q6W9L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M2Q6W9L1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M2Q6W9L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M2Q6W9L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms