Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc57Q6PHN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc57Q6PHN1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc57Q6PHN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc57Q6PHN1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc57Q6PHN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms