Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx6Q6P8X1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx6Q6P8X1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx6Q6P8X1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx6Q6P8X1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx6Q6P8X1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx6Q6P8X1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx6Q6P8X1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx6Q6P8X1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms