Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,51■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccdc148Q6P5U8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc148Q6P5U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ccdc148Q6P5U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccdc148Q6P5U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,5 ms